晋惠帝名叫司马衷，字正度，是晋武帝的第二个儿子。泰始三年，年仅九岁的他就被立为皇太子。太熙元年四月己酉日，晋武帝驾崩，就在这一天，司马衷登上皇帝宝座，宣布大赦天下，把年号改为永熙。他尊皇后杨氏为皇太后，册封自己的妃子贾氏为皇后。
到了夏天五月辛未日，晋武帝被安葬在峻阳陵。丙子日，朝廷给天下官员普遍提升一级官位，参与晋武帝丧事的官员则提升两级，还免除百姓一年的租税和户调，二千石以上的官员都被封为关中侯。同时，任命太尉杨骏为太傅，辅佐朝政。
这年秋天八月壬午日，晋惠帝立广陵王司马遹为皇太子，让中书监何劭担任太子太师，吏部尚书王戎担任太子太傅，卫将军杨济担任太子太保。还派遣南中郎将石崇、射声校尉胡奕、长水校尉赵俊、扬烈将军赵欢带领屯兵分赴四方。
冬天十月辛酉日，任命司空石鉴为太尉，前镇西将军、陇西王司马泰为司空。
永平元年正月乙酉初一，晋惠帝临朝听政，但因为还在为父亲守丧，所以没有奏乐。他下诏说：“我早早地就遭遇不幸，一直沉浸在悲痛之中。多亏祖宗在天之灵护佑，还有忠诚贤能的宰辅大臣，才让我这个渺小之人能处在各位诸侯之上。我对治国大道还不太明白，也不熟悉各种训诫，每天都战战兢兢，如临危境。之前在哀痛迷茫之际，三公等重要大臣为了国家社稷，遵循先帝去世后新君继位的旧典，我本想一直奉行先皇的制度，所以定下了永熙这个年号。然而时光飞逝，已经进入新年，按照礼制，新的开始要更换纪元。那就把永熙二年改为永平元年。”他还下诏，禁止子弟和群官去拜谒皇陵。
丙午日，皇太子举行冠礼，丁未日，前往太庙拜谒。二月甲寅日，赏赐王公以下官员数量不等的帛。癸酉日，镇南将军楚王司马玮、镇东将军淮南王司马允前来京城朝见。戊寅日，朝廷重新设置秘书监这个官职。
三月辛卯日，发生了大事，太傅杨骏以及他的弟弟卫将军杨珧、太子太保杨济、中护军张劭、散骑常侍段广和杨邈、左将军刘预、河南尹李斌、中书令蒋俊、东夷校尉文淑、尚书武茂等人都被诛杀，并且被夷灭三族。第二天壬辰日，晋惠帝大赦天下，更改年号。贾后假传诏书，把皇太后杨氏废为庶人，将她迁到金墉城，还祭告天地和宗庙。随后又杀了太后的母亲庞氏。
壬寅日，征召大司马、汝南王司马亮为太宰，与太保卫瓘一同辅政。任命秦王司马柬为大将军，东平王司马楙为抚军大将军，镇南将军、楚王司马玮为卫将军，兼任北军中候，下邳王司马晃为尚书令，东安公司马繇为尚书左仆射，并将司马繇进封为东安王。这次得到封侯的督将有一千零八十一人。庚戌日，东安王司马繇和东平王司马楙被免官，司马繇被流放到带方。
夏四月癸亥日，任命征东将军、梁王司马肜为征西大将军，都督关西诸军事；太子少傅阮坦为平东将军，监青徐二州诸军事。己巳日，让太子太傅王戎担任尚书右仆射。五月甲戌日，毗陵王司马轨去世。壬午日，免除天下百姓的户调中的绵绢，赏赐给那些孝顺父母、敬爱兄长、年高有德、鳏寡孤独以及努力耕种的人帛，每人三匹。
六月，贾后又假传诏书，指使楚王司马玮杀掉了太宰、汝南王司马亮和太保、菑阳公卫瓘。乙丑日，又以司马玮擅自杀害司马亮和卫瓘为由，把他也杀了。朝廷特赦洛阳地区的罪犯。任命广陵王师刘寔为太子太保，司空、陇西王司马泰录尚书事。
秋天七月，从扬州、荆州分出十个郡，设立江州。八月庚申日，任命赵王司马伦为征东将军，都督徐兖二州诸军事；河间王司马颙为北中郎将，镇守邺城；太子太师何劭为都督豫州诸军事，镇守许昌。把长沙王司马乂改封为常山王。己巳日，将西阳公司马羕的爵位晋升为王。辛未日，立陇西王世子司马越为东海王。
九月甲午日，大将军、秦王司马柬去世。辛丑日，征召征西大将军、梁王司马肜为卫将军，录尚书事，任命赵王司马伦为征西大将军，都督雍梁二州诸军事。冬天十二月辛酉日，京城发生地震。这一年，十七个东夷国家、二十四个南夷部落都到校尉处请求归附。
晋惠帝永平二年，这一年的开头就不太平。二月己酉日，贾后竟然在金墉城残忍地杀害了皇太后，这宫廷里的斗争实在是太残酷了，皇太后就这么含冤离世，让人唏嘘。好不容易熬到了秋天八月壬子日，朝廷宣布大赦天下，像是想给这压抑的局面带来点喘息的机会。九月乙酉日，中山王司马耽去世，这一桩桩的事情，让这一年显得格外沉重。到了冬天十一月，还爆发了大规模的瘟疫，百姓们可遭了殃，日子过得苦不堪言。而且这一年沛国还下起了冰雹，把麦子都砸坏了，农民们一年的辛苦算是白费了，生活真是雪上加霜。
永平三年夏天四月，荥阳下起了冰雹。六月的时候，弘农郡的冰雹更是严重，积雪深达三尺。这老天爷像是故意作对，让百姓们的日子不好过。到了冬天十月，太原王司马泓也去世了，这一年里，死亡的阴影似乎一直笼罩着。
永平四年正月丁酉初一，侍中、太尉、安昌公石鉴也离开了人世。这一年夏天五月，更是祸事连连。蜀郡发生山移，淮南寿春洪水泛滥，还出现山崩地陷，官府和百姓的房屋都被毁坏。匈奴的郝散造反，攻打上党，把当地的长官都杀了。六月，寿春发生强烈地震，二十多户人家因此丧命。上庸郡也山崩了，二十多人不幸遇难。好不容易到了八月，郝散带着众人投降，结果冯翊都尉却把他杀了，这操作实在让人看不懂。同时，上谷居庸和上庸都地陷开裂，泉水涌出，还有人因此死亡。粮食严重短缺，百姓们忍饥挨饿。九月丙辰日，朝廷赦免了那些遭受地灾的诸州百姓，也算是给受灾的人们一点慰藉。甲午日，有流星划过东北天空，这一年，京城和八个郡国都发生了地震，整个西晋都处在动荡不安之中。
永平五年夏天四月，西方出现了彗星，光芒扫过奎宿，一直延伸到轩辕星附近，在古代，这种天象往往被视作不祥之兆。六月，金城发生地震。东海则下起了冰雹，深达五寸。秋天七月，下邳刮起暴风，把房屋都吹坏了。九月，雁门、新兴、太原、上党刮起大风，庄稼被吹得七零八落。到了冬天十月，武库突然失火，历代积攒的宝贝都被付之一炬，损失惨重。十二月丙戌日，朝廷开始重新修建武库，还大规模征调兵器。丹杨也下起了冰雹。京城宜年里竟然还莫名生出一块石头，这一年，荆、扬、兖、豫、青、徐等六个州都遭遇了大水灾，朝廷赶忙派御史去巡查，发放物资赈济百姓，这日子可真是多灾多难。
永平六年正月，朝廷再次大赦天下，希望能冲一冲这连年的晦气。司空、下邳王司马晃去世。之后，朝廷任命中书监张华为司空，太尉、陇西王司马泰为尚书令，卫将军、梁王司马肜为太子太保。丁丑日，又发生了地震。三月，东海降霜，桑树和麦子都被冻伤。彭城吕县还出现了诡异的流血现象，血迹绵延东西一百多步。夏天四月刮起大风。五月，荆、扬二州发大水。匈奴郝散的弟弟郝度元带着冯翊、北地的马兰羌、卢水胡造反，攻打北地，北地太守张损战死。冯翊太守欧阳建和郝度元交战，结果欧阳建战败。朝廷紧急征召征西大将军、赵王司马伦为车骑将军，让太子太保、梁王司马肜担任征西大将军，都督雍梁二州诸军事，镇守关中。秋天八月，雍州刺史解系又被郝度元打败。秦雍地区的氐族、羌族全部反叛，还推举氐族首领齐万年称帝，包围了泾阳。冬天十月乙未日，朝廷特赦雍、凉二州。十一月丙子日，派遣安西将军夏侯骏、建威将军周处等人去讨伐齐万年，梁王司马肜则驻军在好畤。这时候关中地区又闹饥荒，还流行起了大瘟疫，百姓们生活在水深火热之中，西晋的局势也愈发岌岌可危。
永平七年，刚开年就传来噩耗。正月癸丑日，周处和齐万年在六陌大战，结果朝廷的军队吃了败仗，周处也战死沙场，实在是可惜。夏天五月，鲁国下起了冰雹。秋天七月，雍州和梁州闹起了瘟疫，还碰上大旱，又降霜，秋天的庄稼都被冻死了。关中地区闹饥荒，米价飙升到一万钱一斛，百姓们实在活不下去，朝廷无奈之下，下诏允许百姓卖儿卖女来换口饭吃。丁丑日，司徒、京陵公王浑去世。九月，朝廷让尚书右仆射王戎做司徒，太子太师何劭当尚书左仆射，这人事变动也算是为应对乱局做的调整。
到了八年，正月丙辰日发生地震。朝廷赶紧下令打开粮仓，赈济雍州挨饿的百姓，也算是给百姓们雪中送炭。三月壬戌日，宣布大赦天下，想借这个机会冲冲霉运。夏天五月，郊禖石裂成两半，这在古人看来可不是什么好兆头。秋天九月，荆、豫、扬、徐、冀等五个州遭遇大水灾，不过好在雍州这一年收成不错，算是不幸中的万幸。
九年正月，左积弩将军孟观去讨伐氐族，在中亭打了一场漂亮的胜仗，把齐万年给活捉了，这可算是个大喜事。朝廷召回征西大将军、梁王司马肜，让他录尚书事。任命北中郎将、河间王司马颙为镇西将军，镇守关中；成都王司马颖为镇北大将军，镇守邺城，重新安排军事部署，稳定局势。夏天四月，邺城有个叫张承基的人妖言惑众，还擅自封官许愿，聚集了几千人。郡县赶紧派人把他们抓起来，全都处死，这种扰乱民心的行为可不能姑息。六月戊戌日，太尉、陇西王司马泰去世。秋天八月，让尚书裴頠担任尚书仆射。冬天十一月甲子初一，发生了日食。京城刮起大风，把房屋都吹倒了，树木也被连根拔起，这天气真是反常。十二月壬戌日，朝廷把皇太子司马遹废为庶人，还把他和三个儿子幽禁在金墉城，甚至把太子的母亲谢氏也杀了，这皇室内部的争斗太残酷了。
永康元年正月癸亥初一，朝廷大赦天下，还改了年号，想着能有个新开始。己卯日，又出现日食。丙子日，皇孙司马虍林去世。二月丁酉日，刮起大风，飞沙走石，大树都被拔起来了。三月，尉氏下起血雨，南方还出现了妖星，这一桩桩怪事，让人心惶惶。癸未日，贾后假传诏书，在许昌害死了被废的庶人司马遹。夏天四月辛卯日，又发生日食。癸巳日，梁王司马肜、赵王司马伦假传诏书，把贾后废为庶人，司空张华、尚书仆射裴頠都惨遭杀害，侍中贾谧和他的党羽几十人也都被处死。第二天甲午日，赵王司马伦又假传诏书大赦天下，自己当上相国、都督中外诸军，就像当年司马昭辅佐曹魏那样，还追复了原来皇太子的地位。丁酉日，任命梁王司马肜为太宰，左光禄大夫何劭为司徒，右光禄大夫刘寔为司空，淮南王司马允为骠骑将军。己亥日，赵王司马伦假传诏书，在金墉城害死了贾庶人。五月己巳日，立皇孙司马臧为皇太孙，司马尚为襄阳王。六月壬寅日，把愍怀太子司马遹葬在显平陵。抚军将军、清河王司马遐去世。癸卯日，崇阳陵的标志物被雷劈了。秋天八月，淮南王司马允起兵讨伐赵王司马伦，可惜没成功，司马允和他的两个儿子秦王司马郁、汉王司马迪都被杀害。朝廷特赦洛阳地区的罪犯。平东将军、彭城王司马植去世。把吴王司马晏改封为宾徒县王。任命齐王司马冏为平东将军，镇守许昌；光禄大夫陈准为太尉、录尚书事。九月，把司徒改为丞相，让梁王司马肜担任。冬天十月，黄雾弥漫四方。十一月戊午日，大风刮起沙石，整整六天才停止。甲子日，立羊氏为皇后，大赦天下，还摆酒宴庆祝了三天。十二月，东方出现彗星。与此同时，益州刺史赵廞和略阳流民李庠杀害成都内史耿胜、犍为太守李密、汶山太守霍固、西夷校尉陈总，占据成都造反了。
永宁元年正月乙丑日，赵王司马伦干了件惊天动地的大事，他篡夺了皇位。这可不得了，第二天丙寅日，就把晋惠帝司马衷赶到金墉城，还给他安了个“太上皇”的名号，连金墉城都改叫永昌宫了。可怜的皇太孙司马臧也被废为濮阳王。那段时间，天上五星乱行，在天空中纵横交错，毫无规律，古人都觉得这是天下大乱的征兆，看来还真应验了。癸酉日，司马伦还不放过濮阳王司马臧，把他给害死了。好在略阳流民李特把造反的赵廞给杀了，还把他的脑袋送到京城，算是给朝廷出了口气。
到了三月，平东将军、齐王司马冏看不下去司马伦的篡位行径，起兵讨伐他，还发檄文到各个州郡，军队驻扎在阳翟。这一呼百应，征北大将军、成都王司马颖，征西大将军、河间王司马颙，常山王司马乂，豫州刺史李毅，兖州刺史王彦，南中郎将、新野公司马歆，纷纷起兵响应，一下子就聚集了几十万人马，这阵仗可不小。司马伦赶忙派他的将领闾和出兵伊阙，张泓、孙辅出兵堮坂去抵挡司马冏，孙会、士猗、许超出兵黄桥对抗司马颖。结果孙会等人和司马颖的将领赵骧、石超在湨水交战，被打得大败，丢盔弃甲，连军队都顾不上就跑了。闰月丙戌初一，还发生了日食，这一连串的变故，让人感觉这世道真是乱透了。
夏天四月，木星白天都能看见，这可不寻常。司马冏的将领何勖、卢播在阳翟攻打张泓，大获全胜，还斩杀了孙辅等人。辛酉日，左卫将军王舆和尚书、淮陵王司马漼带兵冲进皇宫，抓住了司马伦的党羽孙秀、孙会、许超、士猗、骆休等人，把他们全都砍了脑袋。然后把司马伦赶回他自己的府邸，当天晋惠帝就重新回宫复位。大臣们都纷纷磕头请罪，晋惠帝还挺大度，说：“这不是你们的过错。”
癸亥日，晋惠帝下诏书说：“我德行不足，继承皇位后，远不能成就大业，让四方安定；近不能严明刑罚，遏制奸邪，以至于逆臣孙秀竟敢肆意妄为，窥视王室，还捧赵王司马伦霸占皇位。镇东大将军、齐王司马冏，征北大将军、成都王司马颖，征西大将军、河间王司马颙，都是品德高尚的皇室宗亲，忠心谋划，十分显著，率先发起大计，拯救国难。尚书司马漼一起参与大谋，左卫将军王舆和各位公卿大臣，共同出谋划策，亲自带领本部人马，斩杀孙秀和他的两个儿子。之前赵王司马伦被孙秀误导，他和他的儿子们已经到金墉城把我从幽禁的地方接回皇宫，重回朝堂。这哪是我一个人享受这份福气，实在是宗庙社稷有依靠啊。”于是宣布大赦天下，更改年号，给孤寡老人赐谷五斛，还摆宴庆祝了五天。接着把赵王司马伦、义阳王司马威、九门侯司马质等人以及司马伦的党羽全都诛杀。
五月，立襄阳王司马尚为皇太孙。六月戊辰日，又一次大赦天下，给官员们提升两级官位。还把之前改封的宾徒王司马晏重新封为吴王。庚午日，东莱王司马蕤和左卫将军王舆谋划着要废掉齐王司马冏，结果事情泄露，司马蕤被废为庶人，王舆被处死，还被灭了三族。甲戌日，任命齐王司马冏为大司马、都督中外诸军事，成都王司马颖为大将军、录尚书事，河间王司马颙为太尉。废除丞相一职，重新设置司徒。己卯日，让梁王司马肜担任太宰，兼任司徒。还封齐王司马冏的功臣葛旟为牟平公，路季为小黄公，卫毅为平阴公，刘真为安乡公，韩泰为封丘公。
秋天七月甲午日，立吴王司马晏的儿子司马国为汉王，把常山王司马乂重新封为长沙王。八月，再次大赦天下。戊辰日，赦免那些被流放到边疆的人。益州刺史罗尚去讨伐羌人，取得了胜利。己巳日，把南平王司马祥改封为宜都王。下邳王司马韡去世。任命东平王司马楙为平东将军、都督徐州诸军事。九月，追复原东安王司马繇的爵位。丁丑日，封楚王司马玮的儿子司马范为襄阳王。冬天十月，流民李特在蜀地造反，这西晋真是一波未平一波又起。
十二月，司空何劭去世。封齐王司马冏的儿子司马冰为乐安王，司马英为济阳王，司马超为淮南王。这一年，十二个郡国遭遇旱灾，六个郡国闹蝗灾。
太安元年正月庚子日，安东将军、谯王司马随去世。到了三月癸卯日，朝廷宣布赦免司、冀、兖、豫四个州的罪犯，想着能给这乱糟糟的局面带来一丝缓和。可紧接着，皇太孙司马尚不幸离世，唉。
夏天四月，彗星大白天就出现在天空，在古代，这常被看作是不祥之兆，似乎预示着更大的动荡即将来临。五月乙酉日，侍中、太宰，还兼任司徒的梁王司马肜去世，他在朝中也是颇有地位，他的离去让朝堂的局势更加微妙。随后，朝廷任命右光禄大夫刘寔为太傅。而此时，太尉、河间王司马颙派将领衙博到蜀地攻打李特，结果却被李特打得大败。李特乘胜追击，接连攻陷梓潼、巴西，还杀害了广汉太守张微，自封大将军，势力越来越大。
癸卯日，朝廷立清河王司马遐的儿子司马覃为皇太子，为了安抚民心，给孤寡之人赏赐了帛，还摆宴庆祝了五天。同时，任命齐王司马冏为太师，东海王司马越为司空。
秋天七月，兖、豫、徐、冀等四个州遭遇了大水灾，百姓们的家园被冲毁，生活陷入困境。冬天十月，又发生了地震，这一年真是多灾多难。到了十二月丁卯日，河间王司马颙上表弹劾齐王司马冏，说他觊觎皇位，心怀不轨，还联合成都王司马颖、新野王司马歆、范阳王司马虓一同来到洛阳，请求废掉司马冏，让他回家。长沙王司马乂于是带着皇帝的车驾驻扎在南止车门，向司马冏发起进攻，最终杀掉了司马冏，还把他的几个儿子幽禁在金墉城，把司马冏的弟弟北海王司马寔也给废了。之后朝廷大赦天下，更改年号。任命长沙王司马乂为太尉、都督中外诸军事，还封东莱王司马蕤的儿子司马炤为齐王。
太安二年，正月甲子初一，朝廷赦免判五年以下刑罚的罪犯。三月，李特成功攻陷益州，这对西晋的统治来说是个不小的打击。好在荆州刺史宋岱出兵攻打李特，还把他斩杀了，将他的首级送到京城，算是暂时解了蜀地的燃眉之急。
可到了夏天四月，李特的儿子李雄又占领了益州，局势再次失控。五月，义阳蛮张昌起兵造反，他拥立山都人丘沈为主，让丘沈改姓刘，假冒汉朝名号，建立神凤年号，一路攻城略地，南阳太守刘彬，平南将军羊伊，镇南大将军、新野王司马歆都惨遭杀害，叛军的势力迅速扩张。
六月，朝廷派荆州刺史刘弘等人到方城讨伐张昌，没想到朝廷的军队吃了败仗。秋天七月，中书令卞粹、侍中冯荪、河南尹李含等人对长沙王司马乂心怀异心，司马乂起了疑心，把他们都给杀了。与此同时，张昌攻陷了江南的各个郡，武陵太守贾隆、零陵太守孔纮、豫章太守阎济、武昌太守刘根都被杀害。张昌的另一路将领石冰进犯扬州，扬州刺史陈徽与之交战，大败而归，扬州各郡都被叛军占领。临淮人封云也起兵响应张昌，从阜陵进犯徐州，局势变得愈发严峻。
八月，河间王司马颙、成都王司马颖起兵讨伐长沙王司马乂，皇帝任命司马乂为大都督，率军抵抗。庚申日，刘弘和张昌在清水交战，终于斩杀了张昌，算是给这场叛乱来了个致命一击。但另一边，司马颙派将领张方，司马颖派将领陆机、牵秀、石超等人逼近京城。乙丑日，皇帝前往十三里桥，派将军皇甫商到宜阳抵御张方。己巳日，皇帝回到宣武场。庚午日，住在石楼。这天天空突然从中裂开，没有云却响起雷声，这怪异的现象让人心惊胆战。
九月丁丑日，皇帝驻扎在河桥。壬午日，皇甫商被张方打败。甲申日，皇帝驻军在芒山。丁亥日，前往偃师。辛卯日，住在豆田。癸巳日，尚书右仆射、兴晋侯羊玄之去世。皇帝回到城东。丙申日，进军缑氏，攻打牵秀，把他给打跑了，还宣布大赦天下。可张方却趁机攻入京城，烧毁了清明、开阳二门，百姓死伤无数。石超又在缑氏逼迫皇帝。
冬天十月壬寅日，皇帝回到宫中。石超烧毁缑氏，皇帝的服饰、车驾等物品被洗劫一空。丁未日，朝廷军队在东阳门外打败牵秀、范阳王司马虓。戊申日，在建春门打败陆机，石超逃走，朝廷军队斩杀了陆机的大将贾崇等十六人，还把他们的首级悬挂在铜驼街示众。张方则退到十三里桥屯兵。
十一月辛巳日，白天有流星坠落，还伴有雷鸣般的声响。朝廷军队攻打张方的营垒，没有成功。张方掘开千金堨，水碓都干涸了。无奈之下，朝廷征发王公的奴婢用手舂米来供应军粮，一品以下不随军出征的男子，十三岁以上都要服劳役，还征发奴隶补充兵力，号称四部司马。此时公私都陷入困境，米价涨到一万钱一石，朝廷的诏命能控制的范围，也就只有京城这一座城了。壬寅夜，红色的雾气布满天空，还隐隐传来声响。丙辰日，发生地震。癸亥日，东海王司马越抓住长沙王司马乂，把他幽禁在金墉城，不久后司马乂就被张方杀害。甲子日，朝廷大赦天下。丙寅日，扬州秀才周玘、前南平内史王矩、前吴兴内史顾秘发起义军讨伐石冰，石冰抵挡不住，从临淮逃往寿阳。征东将军刘准派广陵度支陈敏攻打石冰。另一边，李雄从郫城攻打益州刺史罗尚，罗尚弃城而逃，李雄占领了整个成都地区。朝廷封鲜卑段勿尘为辽西公。
永兴元年正月丙午日，尚书令乐广去世，成都王司马颖在邺城上书皇帝，于是朝廷大赦天下，把年号改为永安。
当时皇帝被河间王司马颙逼迫，秘密下诏给雍州刺史刘沈、秦州刺史皇甫重，让他们去讨伐司马颙。
刘沈起兵攻打长安，可惜被司马颙打败。张方在洛阳大肆抢掠一番后，回到长安。这下可好，军队里闹起了严重的饥荒，甚至出现人吃人的惨状。随后，朝廷任命成都王司马颖为丞相。司马颖派从事中郎盛夔等人率领五万兵马，驻扎在洛阳的十二座城门前，只要是殿中他所猜忌的人，司马颖统统杀掉，还派三部兵代替原来的宿卫。
二月乙酉日，皇后羊氏被废，幽禁在金墉城，皇太子司马覃也被废黜，重新变回清河王。三月，陈敏攻打石冰，成功将其斩杀，扬州和徐州这两个地方终于平定下来，算是这段时间里的一点好消息。河间王司马颙上表请求立成都王司马颖为皇太弟。戊申日，皇帝下诏说：“我德行不足，继承皇位已经十五年了。祸乱滔天，奸逆不断兴起，甚至把我幽禁在深宫，宗庙都差点断绝祭祀。成都王司马颖温和仁爱、宽厚和善，能够平定暴乱。现在就立司马颖为皇太弟、都督中外诸军事，丞相的职位照旧。”同时大赦天下，赏赐给鳏寡老人和高寿者帛三匹，还摆宴庆祝了五天。丙辰日，竟然发生了盗窃太庙服器的事情，这可是对皇室尊严的严重挑衅。之后，朝廷任命太尉司马颙为太宰，太傅刘寔为太尉。
六月，新建了三座城门。秋天七月丙申初一，右卫将军陈眕拿着诏书召集百官进入殿中，趁机带兵讨伐成都王司马颖。戊戌日，大赦天下，恢复了皇后羊氏和皇太子司马覃的地位。己亥日，司徒王戎、东海王司马越、高密王司马简、平昌公司马模、吴王司马晏、豫章王司马炽、襄阳王司马范、右仆射荀藩等人，拥戴皇帝向北出征，到达安阳时，军队已经有十多万人。司马颖派他的将领石超迎战。己未日，朝廷的六军在荡阴被打得大败，乱箭都射到皇帝的车驾上了，百官四处逃散，侍中嵇绍为了保护皇帝，不幸战死。皇帝脸颊受伤，还中了三箭，连六枚玉玺都弄丢了。皇帝无奈，只能逃到石超的军中，饿得不行，石超给他送来了水，身边的人还献上秋桃。石超派弟弟石熙护送皇帝前往邺城，司马颖率领众官员在道路左边迎接。皇帝下车后痛哭流涕，当晚就住在司马颖的军营里。司马颖的府中有天子赏赐的九锡之仪，陈留王送来了貂蝉文衣和鹖尾。第二天，就准备好天子车驾，皇帝前往邺城，只有豫章王司马炽、司徒王戎、仆射荀藩跟随。庚申日，大赦天下，把年号改为建武。
八月戊辰日，司马颖杀害了东安王司马繇。张方又一次进入洛阳，再次废掉皇后羊氏和皇太子司马覃。匈奴左贤王刘元海在离石造反，自称为大单于。安北将军王浚派乌丸骑兵到邺城攻打成都王司马颖，把他打得大败。司马颖和皇帝只能坐着一辆车逃到洛阳，一路上服御之物散落，匆忙之间，上下都没有钱财，侍中黄门的袋子里藏着三千私钱，皇帝下诏借来使用。到了地方就买饭吃，宫人只能在路边的客舍里吃饭。有宫人拿着一升多粇米饭和干蒜、盐豉献给皇帝，皇帝吃了，用的是中黄门的布被。到了获嘉，买了粗米饭，用瓦盆装着，皇帝吃了两盆。有个老父献上蒸鸡，皇帝接受了。到了温县，皇帝想要拜谒皇陵，却丢了鞋子，只好穿上随从的鞋子，下拜时痛哭流涕，身边的人都跟着唏嘘不已。等到渡过黄河，张方率领三千骑兵，用阳燧青盖车来迎接皇帝。张方下拜谒见，皇帝亲自制止。辛巳日，大赦天下，对随从的人都有不同的赏赐。
冬天十一月乙未日，张方请皇帝去拜谒太庙，实际上是劫持皇帝前往长安。张方把自己乘坐的车开进殿中，皇帝吓得跑到后园的竹林里躲避。张方强行逼迫皇帝上车，只有十二个中黄门和鼓吹手步行跟随，只有中书监卢志在皇帝身边侍奉。张方带着皇帝到了自己的营垒，皇帝命令张方准备车辆装载宫人和宝物，结果军人趁机霸占后宫女子，争抢府库中的财物。魏晋以来积攒的财富，就这样被洗劫得一干二净。走到新安的时候，天气非常寒冷，皇帝从马上摔下来，伤了脚，尚书高光献上了面衣，皇帝很是赞赏。河间王司马颙率领三万官属步兵和骑兵，在霸上迎接皇帝。司马颙上前拜谒，皇帝下车制止。之后就把征西府当作皇宫。只有仆射荀藩、司隶刘暾、太常郑球、河南尹周馥和他们的下属留在洛阳，组成留台，秉承皇帝旨意行事，和长安这边的朝廷被称为东西台。丙午日，留台宣布大赦天下，把年号又改回永安。辛丑日，恢复了皇后羊氏的地位。这时候，李雄在成都僭越称帝，刘元海在北方僭越称汉王。十二月丁亥日，皇帝下诏说：“上天降祸给晋朝，皇位继承人没有合适的。成都王司马颖自从成为皇储，政绩不佳，让天下人失望，不能承担重任，让他回到自己的王府。豫章王司马炽是先帝的爱子，美好的名声日益显著，受到天下人的关注，现在立他为皇太弟，来振兴我们晋朝。任命司空司马越为太傅，和太宰司马颙一起辅佐我。司徒王戎参与管理朝政，光禄大夫王衍为尚书左仆射。安南将军司马虓、安北将军王浚、平北将军司马腾各自镇守本镇。高密王司马简为镇南将军，兼任司隶校尉，暂时镇守洛阳；东中郎将司马模为宁北将军、都督冀州，镇守邺城；镇南大将军刘弘兼任荆州刺史，镇守南方；周馥、缪胤各自回到自己的驻地，朝廷百官也都恢复原职。齐王司马冏之前就该回府，长沙王司马乂却被轻易判了重刑，于是朝廷封司马乂的儿子司马绍为乐平县王，好延续他这一脉。由于近来战事频繁，耗费大量人力，供给皇室的物品都减少了三分之二，户调田租也减免了三分之一。朝廷还废除了一些苛刻的政令，一心爱护百姓，注重农业这个根本。等局势清平之后，就回到东京洛阳。”
随后，皇帝大赦天下，更改年号为永兴，让河间王司马颙都督中外诸军事。
永兴二年正月甲午初一，皇帝还在长安。夏天四月，下诏封乐平王司马绍为齐王。丙子日，张方又一次废掉了皇后羊氏，这皇后的命运可真是坎坷。六月甲子日，侍中、司徒、安丰侯王戎去世，他在朝堂上也是有一定影响力的人物，他的离世让朝堂的局势又起了一些变化。陇西太守韩稚攻打秦州刺史张辅，并把他杀了。而在这时候，李雄僭越称帝，国号为蜀，西晋的局势愈发复杂。
秋天七月甲午日，尚书各曹突然失火，把崇礼闼都给烧毁了，这可真是屋漏偏逢连夜雨。东海王司马越在徐州整肃军队，打算往西去迎接皇帝。成都王司马颖的部将公师藩等人聚众攻陷了不少郡县，杀害了阳平太守李志、汲郡太守张延等官员，还转头攻打邺城，好在平昌公司马模派将军赵骧把他们打败了。八月辛丑日，朝廷大赦天下，想借此缓和一下紧张的局势。骠骑将军、范阳王司马虓赶走了冀州刺史李义。扬州刺史曹武杀了丹杨太守朱建。李雄派他的将领李骧进犯汉安。车骑大将军刘弘在宛城赶走了平南将军、彭城王司马释。
九月庚寅初一，公师藩又杀害了平原太守王景、清河太守冯熊。庚子日，豫州刺史刘乔在许昌攻打范阳王司马虓，把他打败了。壬子日，朝廷任命成都王司马颖为镇军大将军、都督河北诸军事，镇守邺城。河间王司马颙派将军吕朗屯兵洛阳。
冬天十月丙子日，皇帝下诏说：“收到豫州刺史刘乔的檄文，说颍川太守刘舆逼迫威胁骠骑将军司马虓，违抗诏令，制造叛乱，擅自劫持郡县官员，聚集兵力，还擅自任用苟晞为兖州刺史，阻断王命传达。镇南大将军、荆州刺史刘弘，平南将军、彭城王司马释等人，各自统领所部，直接到许昌会合，和刘乔一起出力。现在派右将军张方为大都督，统领十万精兵，建武将军吕朗、广武将军骞貙、建威将军刁默等为前锋，一起到许昌，铲除刘舆兄弟。”丁丑日，又派前车骑将军石超、北中郎将王阐去讨伐刘舆等人。这时候，北方天空出现红色的云气，从东到西横贯天空。还有彗星出现在北斗星附近，在古人看来，这些都是不祥之兆。平昌公司马模派将军宋胄等人屯兵河桥。
十一月，立节将军周权假称接到檄文，自称平西将军，恢复了皇后羊氏的地位。可洛阳令何乔攻打周权，把他杀了，又一次废掉了皇后。十二月，吕朗等人往东屯兵荥阳，成都王司马颖进占洛阳，张方、刘弘等人都按兵不动，无法抵御。范阳王司马虓从官渡渡河，攻下荥阳，斩杀石超，袭击许昌，在萧县打败刘乔，刘乔逃到南阳。右将军陈敏起兵造反，自号楚公，假称接到宫中诏书，要从沔汉之地去奉迎天子，还赶走了扬州刺史刘机、丹杨太守王旷，派弟弟陈恢往南攻略江州，江州刺史应邈逃到弋阳。
光熙元年正月戊子初一，发生了日食，此时皇帝还在长安。河间王司马颙听说刘乔战败，十分惊恐，于是杀掉张方，向东海王司马越求和，但司马越没有答应。宋胄等人打败了司马颖的将领楼裒，进而逼近洛阳，司马颖逃往长安。甲子日，司马越派他的将领祁弘、宋胄、司马纂等人去迎接皇帝。
三月，东莱<巾弦>县县令刘柏根造反，自称为<巾弦>公，袭击临淄，高密王司马简逃到聊城。王浚派将领讨伐刘柏根，将其斩杀。
夏天四月己巳日，东海王司马越驻扎在温县。司马颙派弘农太守彭随、北地太守刁默在湖县抵御祁弘等人。五月，有枉矢星向西南方向流去。范阳国的土地燃烧起来，甚至可以用来烧火做饭。壬辰日，祁弘等人与刁默交战，刁默大败，司马颙、司马颖逃到南山，又跑到宛城。祁弘等人所率领的鲜卑兵在长安大肆抢掠，杀害了两万多人。当天，日光四散，红得像血一样，甲午日也是如此。己亥日，祁弘等人护送皇帝返回洛阳，皇帝乘坐牛车，临时住所只能以草为席，公卿大臣们也只能艰难跋涉。戊申日，骠骑将军、范阳王司马虓杀掉司隶校尉邢乔。己酉日，有人盗取太庙金匮以及策文各四份。
六月丙辰初一，皇帝从长安回到洛阳，登上原来的宫殿，哀伤感慨，流下眼泪。前往太庙拜谒。恢复皇后羊氏的地位。辛未日，大赦天下，更改年号。
秋天七月乙酉初一，又发生日食。太庙吏贾苞盗窃太庙灵衣及剑，被处死。八月，任命太傅、东海王司马越录尚书事，骠骑将军、范阳王司马虓为司空。九月，顿丘太守冯嵩抓住成都王司马颖，把他押送到邺城。晋升东嬴公司马腾为东燕王，平昌公司马模为南阳王。
冬天十月，司空、范阳王司马虓去世。司马虓的长史刘舆害死成都王司马颖。十一月庚午日，皇帝在显阳殿驾崩，享年四十八岁，葬于太阳陵。
晋惠帝做太子的时候，朝廷上下都知道他没有处理政事的能力，晋武帝也有所怀疑。晋武帝曾把东宫的官员全部召集起来，拿尚书省的政务让太子裁决，晋惠帝无法应对。贾妃就派身边的人代他回答，还大量引用古义。给事张泓说：“太子没什么学问，这陛下是知道的，现在应该就事论事来决断，不能引用书本知识。”贾妃听从了他的建议。张泓于是拟好草稿，让晋惠帝抄写下来。晋武帝看了之后非常高兴，太子的地位也就安稳了下来。
等到晋惠帝登上皇位，政事都由下面的人决定，国家纲纪严重败坏，贿赂公然盛行，有权有势的家族凭借尊贵地位欺压他人，忠贤之路被断绝，谗佞邪恶之人得志，他们相互举荐，天下人称之为“互市”。高平人王沈作《释时论》，南阳人鲁褒作《钱神论》，庐江人杜嵩作《任子春秋》，都是针砭时弊的作品。晋惠帝还曾在华林园，听到蛤蟆的叫声，就问身边的人：“这叫唤的东西是为官家叫呢，还是为私家叫呢？”有人回答说：“在官地就是为官家叫，在私地就是为私家叫。”等到天下灾荒战乱，百姓饿死，晋惠帝说：“为什么不吃肉粥呢？”他的糊涂无知都是这一类的事情。后来晋惠帝因为吃饼中毒驾崩，也有人说是被司马越毒杀的。
史官评论说：没有才能的儿子，却登上皇位，权力不由皇帝掌控，政事被小人左右。就像褒姒和共叔带一起兴起祸乱，周襄王的王后和犬戎一起导致周室衰微。从前，丹朱不成器，周赧王逃避债务，看看这些凶恶的德行，都关系到国家的兴衰，就像泥塑的偶像一样，失去了真正的性情。炎热的暑气即将消散，青蛙的叫声很少被人记住，却彰显出被人嗤笑的事情，最终导致国家的覆灭。难道是那些通才俊彦只出现在前代，而助长邪恶、残害百姓的事情却唯独在当今盛行吗？人们号称忠诚善良，却在此时拔去根本，人们称其为妖孽，从这时开始疏解源头。长乐宫不吉祥，太子宫遭遇厄运，百姓动荡不安，国家沦为废墟。古代那些败国亡身的情况，原因各不相同，但不是违背伦常，就是昏庸愚昧。难道是神明丧失了精魄，晋武帝不了解自己的儿子吗！
赞辞说：晋惠帝位居尊位，临朝听政。他的才智昏昧，性情糊涂。在高台上盼望儿子，漫漫长夜有何冤屈。被废于金墉城，丢掉皇冠，在荡阴之战丢盔弃甲，到最后都走向灭亡，滔天的灾祸终于降临。