林晓从古埃及穿越回现代后，被眼前的景象震惊得说不出话来。原本繁华的城市变得满目疮痍，街道上到处是残垣断壁，天空中弥漫着浓厚的阴霾，灾难频发，人们生活在恐惧和绝望之中。她意识到，自己和霍夫曼的穿越行为已经严重扰乱了时空秩序，必须尽快找到修复的方法，否则整个世界都将面临毁灭。
回到实验室，林晓看到陈教授正对着一堆数据愁眉不展。实验室里的设备也因为时空紊乱受到了不同程度的损坏。林晓将自己的经历详细地告诉了陈教授，两人决定立刻展开研究，寻找修复时空裂痕的方法。
他们查阅了大量的古籍和现代科研资料，对蝴蝶立方进行了无数次的测试和分析。经过艰苦的努力，他们终于发现蝴蝶立方创造的平行宇宙之间存在着一种微妙的联系，就像一张错综复杂的巨大网络，每一个节点都相互关联、相互影响。要修复时空裂痕，就必须精准调整蝴蝶立方的能量频率，使其与各个平行宇宙的能量场重新达到平衡。
然而，调整能量频率谈何容易。每一次尝试都伴随着巨大的风险，如果稍有差错，可能会导致时空进一步紊乱，甚至引发宇宙大崩溃。但林晓和陈教授没有退缩，他们日夜坚守在实验室，不断调整参数，进行模拟实验。
在一次关键的实验中，蝴蝶立方突然失控，释放出强大的能量波动。实验室里的仪器纷纷爆炸，林晓和陈教授陷入了生死危机。就在千钧一发之际，林晓凭借着对蝴蝶立方的深入理解和顽强的意志，成功稳定住了它的能量输出。
经过无数次的失败和尝试，他们终于找到了正确的能量频率组合。林晓小心翼翼地操作着蝴蝶立方，将调整后的能量注入时空裂缝中。随着能量的注入，时空裂缝开始逐渐愈合，城市的景象也慢慢恢复正常。
与此同时，他们通过蝴蝶立方的特殊能力，定位到了被困在混乱时空里的霍夫曼，并将他带回了现实世界。霍夫曼被眼前的景象惊呆了，他终于意识到自己的贪婪和狂妄给世界带来了多大的灾难。
在法律的审判下，霍夫曼为自己的罪行付出了代价。而蝴蝶立方则被陈教授和林晓妥善封存起来，它的秘密被永远埋藏，等待着人类科技和道德水平足以驾驭这份力量的那一天。
林晓望着被封存的蝴蝶立方，心中感慨万千。这次惊心动魄的时空冒险让她深刻认识到，科学的探索永无止境，但在追求知识和力量的道路上，必须始终保持敬畏之心，只有这样，人类才能在宇宙的舞台上稳健前行。